Esses dias lí um post sobre templates para novos projetos em HTML5 (http://flaviosilveira.com/2011/initializr-comece-seu-projeto-html5-em-15-segundos/).
Segue alguns que já ví:
Twitter Bootstrap (temas)
Bootstrap é uma estrutura HTML5, CSS3 e JS projetado para ajudar no desenvolvimento de aplicações web e sites.
Esta template serve para dar um ponta pé inicial na criação de novos projetos. Acredito que foi o precursor para as templates iniciais de projeto.
https://wrapbootstrap.com/
HTML5 Bolierplate
Outro conjunto de HTML5, CSS3 e JS projetado para ajudar no desenvolvimento de aplicações web e sites.
Kickstrap
É uma template criada pensando em camadas. Usa o Bootstrap como uma camada inferior podendo ser atualizada sem que seu código seja impactado. Também usa LESS.
http://getkickstrap.com/
Initializr
É uma ferramenta que permite escolher o que se deseja utilizar no "HTML5 Bolierplate". E também foi adicionado um layout responsive padrão.
http://www.initializr.com/
De todos listados, acredito que o melhor seria Initializr pois combina o Boilerplate com Responsive, porém o Kickstrap parece ser um projeto bem interessante de se acompanhar também.
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